Laboratoire d’accueil : Université Grenoble-Alpes (UGA/IAB), lieu de stage Plateforme Biopark d’Archamps (Haute-Savoie)

Responsable : Dr Philippe BULET, co-responsable scientifique, Michel Bocquet

Téléphone : 04 50 43 25 21
e-mail: philippe.bulet@univ-grenoble-alpes.fr

Adresse : Plateforme BioPark d’Archamps, ArchParc, Bat. Le Forum 2, 218 avenue Marie Curie, 74160 Archamps

Titre du projet : Analyses protéomiques de l’hémolymphe d’abeilles domestiques suite à l’exposition à différents stresseurs.

Objectifs : L’objectif du stage est d’étudier les modifications du protéome du sang de l’abeille domestique suite à une exposition à Varroa destructor et Nosema ceranae dans différentes conditions de nutrition (pollen de bonne ou moins bonne qualité).

Résumé : Le déclin des pollinisateurs représente une préoccupation majeure. Au cours de la dernière décennie, des chercheurs et des organisations ont tenté de clarifier comment les facteurs de stress environnementaux (abiotiques et/ou biotiques) influençaient la santé des pollinisateurs. Néanmoins, des investigations plus approfondies doivent être menées pour mieux élucider les perturbations moléculaires.

Ce stage intervient dans le cadre du projet DESIR, qui cherche à étudier les impacts de deux stresseurs biotiques, l’acarien Varroa destructor, qui se nourrit du sang et du corps gras de l’abeille et le champignon Nosema ceranae, qui envahit le tube digestif de l’abeille. Les modalités expérimentales incluent les deux stresseurs seuls ou en combinaison, dans un contexte de nourriture protéinée de bonne ou de moins bonne qualité. Le projet DESIR est réalisé en collaboration avec les universités d’Albi et de Clermont-Ferrand et un ou deux déplacements sur ces sites sont possibles.

Nous utilisons l’hémolymphe (sang) de l’abeille comme matrice biologique dans une technique que nous appelons le MALDI-BeeTyping, similaire à l’analyse de sang réalisée chez l’homme. Nous comparons les profils peptidiques des abeilles soumises à différents stress, afin d’identifier les signatures et des marqueurs spécifiques de ces stress. Nous complétons cette approche par une approche d’analyse protéomique par couplage chromatographique à la spectrométrie de masse (LC-ESI-MS/MS) qui permet d’obtenir les listes de protéines identifiées dans chaque modalité expérimentale, et de mettre en évidence les voies métaboliques impactées. D’autres techniques complémentaires (spectrophotométrie, Elisa) seront également utilisées pour préciser les variations de marqueurs spécifiques de l’immunité.

Déroulement du stage : L’étudiant(e) sera amené(e) à (i) extraire de l’hémolymphe sur les abeilles expérimentales, (ii) analyser l’hémolymphe par MALDI-BeeTyping (iii) préparer les échantillons pourles analyses protéomiques par LC-ESI-MS/MS (iii) réaliser des analyses complémentaires sur l’hémolymphe (par exemple par spectrophotométrie, Elisa) (iv) intégrer les données et analyser les modifications du protéome à l’aide d’outils généralistes (R, Excel ou Prism) ou de logiciels bio-informatiques dédiés tels que Proteome Discoverer™ et ClinProTools™, et (v) effectuer des analyses d’ontologie génétique pour étudier les processus biologiques dérégulés en réponse aux facteurs de stress à l’aide de OmicsBox,

Compétences recherchées

Bonnes bases en biologie, compréhension du fonctionnement de la spectrométrie de masse et de la chromatographie liquide adaptée aux peptides/protéines, bio-informatique, et bon niveau en anglais.

Niveau demandé

Master 2 ou équivalent

Durée et dates du stage

6 mois, de préférence à partir de février ou mars 2024 période de début de la saison apicole

Personnes à contacter

Dr Philippe Bulet
Téléphone : 04 50 43 25 21
e-mail : philippe.bulet@univ-grenoble-alpes.fr; philippe.bulet@bioprk-archamps.org

Publications récentes du laboratoire

doi: 10.1002/pmic.201900268, doi: 10.1016/j.isci.2020.100828, doi: 10.1021/acs.jproteome.9b00638,

doi: 10.1021/acs.jproteome.9b00851, doi: 10.1021/acs.jproteome.0c00658,

doi: 10.1021/acs.jproteome.0c00658

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Nature du poste : Administratif
Rattachement hiérarchique : Rattaché à la direction

Description du poste :

Relations internes et externes :
Interne : la direction, les collaborateurs privés et/ou publics.
En externe : les clients, les fournisseurs et le public.

Présentation du poste : 
L’assistant(e) administratif(ve) est en charge de la gestion administrative, comptable et organisationnelle de l’entreprise ainsi que de l’accueil des fournisseurs, clients et collaborateurs externes.

Activités principales et secondaires :

• Missions principales :
  • Assurer l’accueil physique et téléphonique
  • Gérer l’agenda de l’entreprise, planifier les rendez-vous, réserver pour l’entreprise et ses usagers (entreprises de biotechnologies) la salle de réunion au besoin
  • Gérer administrativement des dossiers et assurer un suivi financier des commandes et des comptes bancaires
  • Organiser le classement des documents importants et confidentiels de l’entreprise, préparer des fiches de procédures pour une optimisation et la transparence des tâches.
  • Distribuer et organiser le courrier (par exemple, lettres physiques, colis et courriels spécifiques à l’entreprise)
  • Préparer des rapports réguliers sur les dépenses et les budgets de l’entreprise
  • Assurer la mise en place de l’assemblée générale et du conseil d’administration (planifier l’agenda, préparer la convocation et les documents requis, présenter les comptes, rédiger le compte-rendu)
  • Assurer la coordination entre le service administratif de l’entreprise et les services administratifs liés à des contrats de collaborations ou de prestations de services

• Missions secondaires :
  • Fournir une assistance à la comptabilité
  • Rédiger des compte-rendus
  • Planifier et organiser les déplacements et les hébergements des collaborateurs et du Directeur de l’entreprise
  • En cas de besoin organiser les événements internes et externes
  • Suivre et mettre à jour le site internet de l’entreprise et ses réseaux sociaux.

Moyens du poste :
Bureau individuel
Matériel informatique
Logiciels et outils bureautiques dédiés aux missions administratives
Outils de communication

Conditions de travail :
Travail au siège de l’entreprise dans un bureau individuel avec possibilité ponctuelle de télétravail
Temps partiel – 24h/hebdomadaire

Profil du poste :

• Exigences :
  • Expérience avancée/confirmée comme agent administratif ou poste similaire
  • Excellentes compétences de communication orale et rédactionnelle
  • Bonne pratique des procédures de bureau et logiciels bureautiques de type MS Office (en particulier Word et Excel)
  • Notions de comptabilité
  • Idéalement des notions d’anglais
  • Rigueur et grande capacité organisationnelle
  • Sens de l’écoute
  • Capacité d’adaptabilité et de polyvalence
  • Une certaine autonomie
  • Esprit de synthèse
  • Discrétion et respect de la confidentialité